Puerto Rico es un paraíso para las aves, ya que aquí residen numerosas especies, muchas de ellas dispersas por el Caribe y otras que emigran en el invierno desde otros sitios. Para nuestro orgullo, se han identificado alrededor de 17 especies de aves endémicas; o sea, que no viven en ninguna otra parte del mundo.
Nuestras aves endémicas son:
• Mariquita (Agelaius xanthomus)
• Cotorra puertorriqueña (Amazona vittata)
• Zumbador verde (Anthracothorax viridis)
• Guabairo de Puerto Rico (Caprimulgus noctitherus)
• Zumbadorcito de Puerto Rico (Chlorostilbon maugeaus)
• Pájaro bobo mayor (Coccyzus vieilloti)
• Reinita mariposera (Dendroica adelaidae)
• Reinita de bosque enano (Dendroica angelae)
• Comeñame (Loxigilla portoricensis)
• Mucarito (Megascops nudipes)
• Carpintero de Puerto Rico (Melanerpes portoricensis)
• Juí (Myiarchus antillarum)
• Llorosa (Nesospingus speculiferus)
• Reina mora (Spindalis portoricensis)
• San Pedrito (Todus mexicanus)
• Bienteveo (Vireo latimeri)
• Calandria de Puerto Rico (Icterus portoricensis)
También proliferan los anfibios, particularmente los coquíes, de los cuales se han identificado 17 especies. Curiosamente, sólo 2 especies (el coquí común y el coquí de la montaña) cantan "co-qui", mientras otras especies hacen sonidos parecidos a chillidos, gotas cayendo o silbidos. De hecho, sólo los machos cantan porque así atraen a las hembras y espantan a machos rivales. Contrario a la creencia popular de que los coquíes mueren si salen de Puerto Rico, hay coquíes y parientes cercanos (del género Eleutherodactylus) regados por todo el Caribe, la Florida y hasta Hawaii, hasta donde llegaron ocultos en tiestos con plantas. Allá los quieren exterminar pero aquí están amenazados por la pérdida de hábitat y la contaminación.
Los coquíes se distinguen de otros anfibios en que sus dedos no están unidos por membranas y que no ponen huevos en el agua, sino que los depositan en un "nido" acuoso sobre plantas y otras superficies, en donde nacen ya con sus patitas (no como en el caso de los renacuajos).
Las especies de coquíes de Puerto Rico son las siguientes:
• Coquí de la montaña (E.portoricensis)
• Coquí churí (E. antillensis)
• Coquí de las hierbas (E. brittoni)
• Coquí pitito (E. cochranae)
• Coquí guajón (E. cooki)
• Coquí de Eneida (E. eneidae) - Se cree extinto
• Coquí grillo (E. gryllus)
• Coquí de Hedrick (E.hedricki)
• Coquí dorado (E. jasperi) - Se cree extinto
• Coquí llanero (E. juanariveroi)
• Coquí palmeado (E. karlschmidti) - Se cree extinto
• Coquí martillito (E. locustus)
• Coquí de Mona (E. monensis)
• Coquí caoba (E. richmondi)
• Coquí duende (E. unicolor)
• Coquí melodioso (E. wightmanae)
El resto de la fauna nativa de Puerto Rico lo componen reptiles como los lagartijos, iguanas, serpientes, tortugas de río y tortugas marinas (que desovan en nuestras costas). Entre los reptiles se destacan especies endémicas como la boa de Puerto Rico (Epicrates inornatus) y la iguana de la Isla de Mona (Cyclura cornuta stejnegeri). También existen la jicotea o tortuga de río (Trachemys stejnegeri) y 13 especies de lagartijos del género Anolis.
En nuestras playas anidan varias especies de tortugas marinas, tales como:
• Tinglar (Dermochelys coriacea)
• Carey de concha (Eretmochelys imbricata)
• Peje blanco (Chelonia mydas)
Entre los mamíferos nativos sólo se hallan los murciélagos, aunque en el Puerto Rico prehistórico habitaron algunos insectívoros, roedores y edentados, ya extintos. En las aguas costeras viven mamíferos marinos como el manatí (Trichechus manatus) y algunas especies de ballenas y delfines.
En cuanto a los invertebrados, encontramos una enorme variedad de insectos, arácnidos, crustáceos, moluscos y otros.
